<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>scientific magazine yafte</title>
<title_fa>مجله علمی پژوهشی یافته</title_fa>
<short_title>yafte</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://yafte.lums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>72</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal72</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1563-0773</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2981-0779</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.22034/Yafteh</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1393</year>
	<month>11</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2015</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>16</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی عوامل نوکاردیوزیس در نمونه های شستشوی برونش(BAL) بیماران مشکوک به سل مراجعه کننده به بیمارستان های تهران به روش PCR </title_fa>
	<title>The identification of Nocardiosis agents in BAL samples of Patients with suspected tuberculosis admitted to hospitals in Tehran by PCR method</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>پژوهشي اصیل</content_type_fa>
	<content_type>Original Research </content_type>
	<abstract_fa>مقدمه: تشخیص گونه‌های نوکاردیای عامل نوکاردیوزیس در آزمایشگاه های روتین پزشکی بر پایه روش های فنوتیپی است که بسیار مشکل و اغلب طولانی و زمان بر است. هدف از این مطالعه شناسایی عوامل نوکاردیوزیس در نمونه های BAL بیماران مشکوک به سل مراجعه کننده به بیمارستان های تهران به روش PCR است. بحث و نتیجه‌گیری: در مطالعه حاضر استخراج DNA گونه های نوکاردیا در نمونه شستشوی برونش به روش دستی و در حداقل زمان انجام گرفت که سابقه قبلی در ایران نداشت. همچنین بررسی در افراد مشکوک به سل صورت گرفت که به صورت محدود کار شده است، گونه N. cyriacigeorgica گونه غالب عامل نوکاردیوزیس بود که طی سال های اخیر معرفی شده است و باید در آزمایشگاه ها، مراکز درمانی و تحقیقاتی مد نظر قرار گیرد. یافته‌ها: به روش مولکولی Duplex PCR ، نوکاردیوزیس در 7 نمونه (03/6%) تشخیص داده شد. پس از تعیین توالی محصولات PCR، مشخص شد که گونه‌های جداسازی شده متعلق به گونه‌های N. cyriacigeorgica (6 مورد) و N.otitidiscaviarum (1 مورد) می باشد. مواد و روش‌ها: در طی 8 ماه تعداد 116 نمونه شستشوی برونش (BAL) از بیماران بستری در بیمارستان های بقیه ا...(عج)، شریعتی و امام خمینی تهران جمع آوری گردید. استخراج DNA به روش فنل کلروفرم صورت گرفت. جهت انجام Duplex PCR از دو جفت پرایمر NG1 و NG2 اختصاصی جنس نوکاردیا و پرایمرهای BetF و BetR به عنوان ژن استفاده شد. به منظور شناسایی گونه عامل بیماری، محصولات PCR از روی ژل تخلیص و تعیین توالی گردید. </abstract_fa>
	<abstract>Background : Identification of Nocardia spp. in routine medical laboratories is based on phenotypic methods that is often time- consuming. The objective of this study was to diagnose Nocardia agents by PCR technique in BAL samples of patients with suspected tuberculosis admitted to hospitals in Tehran. Materials and Methods: In this study, 116 BAL samples of patients admitted in Baqiyatallah, Imam Khomeini and Shariati hospitals were collected within 8 months. Nocardia DNA was extracted by phenol-chloroform protocol. In Duplex PCR, primers NG1 and NG2 were used to amplify a Nocardia genus- specific 598-bp fragment of 16S rRNA gene. BetF and BetR primers were used as housekeeping gene to amplify 204-bp fragment. Gel-purified PCR products were sequenced. Results: Using Duplex PCR, 7 (%6.03) samples were positive for Nocardia spp. . Sequencing results showed that the species identified were N.cyriacigeorgica (6 case) and N. otitidiscaviarum (1 case). Conclusion: In the present study, DNA extracted from Nocardia Spp. in BAL specimens by manual method during minimum time which had not previous record in Iran. The study also was carried out on patients with suspected tuberculosis which restricted work has already been done on them. In this study, N. cyriacigeorgica was dominant species that has been introduced during recent years, which should be considered in clinical laboratories and research centers. </abstract>
	<keyword_fa>نوکاردیا, واکنش زنجیره پلی مراز, لاواژ برونکو آلوئولار. </keyword_fa>
	<keyword>Nocardia spp, PCR, Bronchoalveolar lavage (BAL)</keyword>
	<start_page>79</start_page>
	<end_page>87</end_page>
	<web_url>http://yafte.lums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1280-34&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Asalbanoo</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Famili</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عسل بانو</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa> فامیلی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>720031947532846009752</code>
	<orcid>720031947532846009752</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kachuei </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa> کچوئی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>kachueiz@yahoo.com</email>
	<code>720031947532846009753</code>
	<orcid>720031947532846009753</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا… (عج ، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mirnejad </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میرنژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>720031947532846009754</code>
	<orcid>720031947532846009754</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا… (عج ، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>NoorAmir</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mozafari </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نورامیر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa> مظفری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>720031947532846009755</code>
	<orcid>720031947532846009755</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>, Faculty of Basic Sciences,Imam hossein University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hasan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mirhaj Mohammad Abadi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسن </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa> میرحاج محمد آبادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>720031947532846009756</code>
	<orcid>720031947532846009756</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department and Biology Research Center, Faculty of Basic Sciences, Imam Hossein University,Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه و مرکز تحقیقات زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه امام حسین(ع)، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
