<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>scientific magazine yafte</title>
<title_fa>مجله علمی پژوهشی یافته</title_fa>
<short_title>yafte</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://yafte.lums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>72</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal72</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1563-0773</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2981-0779</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.22034/Yafteh</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>19</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی مورفولوژیک و مولکولی آسپرژیلوس‌های جداشده از بیماران
 بر اساس تعیین توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin)
</title_fa>
	<title>Identification of morphological and molecular Aspergillus species isolated from patients based on beta-tubulin gene sequencing</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>پژوهشي اصیل</content_type_fa>
	<content_type>Original Research </content_type>
	<abstract_fa>&lt;table align=&quot;center&quot; border=&quot;0&quot; cellpadding=&quot;0&quot; cellspacing=&quot;0&quot; dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;width:595px;border-collapse:collapse;&quot; width=&quot;595&quot;&gt;
	&lt;tbody&gt;
		&lt;tr style=&quot;page-break-inside:avoid;height:22px;&quot;&gt;
			&lt;td style=&quot;width:595px;padding:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt;height:22px;vertical-align:top;&quot;&gt;
			&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مقدمه:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&lt;strong&gt; &lt;/strong&gt;گونه&#8204;های آسپرژیلوس عامل پاتوژن فرصت طلب در افراد دارای ضعف سیستم ایمنی می&#8204;باشند. این قارچ&#8204;ها از جنبه&#8204;های مختلف بیماریزایی و توکسین زایی حائز اهمیت هستند. هدف مطالعه حاضر، ارزیابی ژن بتاتوبولین در تشخیص و تعیین گونه&#8204;های بالینی آسپرژیلوس&#8204; به روش تعیین توالی، در مقایسه با خصوصیات مورفولوژیک (مانند شکل کونیدی&#8204;ها در آزمایش مستقیم، شکل کلنی در کشت و تست&#8204;های فیزیولوژیک) می&#8204;باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
			&lt;/td&gt;
		&lt;/tr&gt;
		&lt;tr style=&quot;page-break-inside:avoid;height:22px;&quot;&gt;
			&lt;td style=&quot;width:595px;padding:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt;height:22px;vertical-align:top;&quot;&gt;
			&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مواد و روش &amp;shy;ها: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;در این مطالعه 465 بیمار مراجعه کننده به آزمایشگاه شفای اصفهان، مورد بررسی قرار گرفتند. شناسایی مورفولوژیک و مولکولی نمونه&#8204; های بالینی، به ترتیب با استفاده از کشت بر روی محیط&#8204; های سابورو آگار، مالت اکسترکت آگار و چاپکس آگار، مشاهده میکروسکوپی نمونه&#8204; ها و تقویت ژن بتا توبولین و تعیین توالی ناحیه مذکور انجام گردید. سکانس&#8204;ها از طریق مقایسه با اطلاعات موجود در بانک ژنی آنالیز شدند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
			&lt;/td&gt;
		&lt;/tr&gt;
		&lt;tr style=&quot;page-break-inside:avoid;height:22px;&quot;&gt;
			&lt;td style=&quot;width:595px;padding:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt;height:22px;vertical-align:top;&quot;&gt;
			&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;یافته&amp;shy; ها: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;از 465 مراجعه کننده مشکوک، 39 مورد بیمار (8%) شناسایی شد. بیشترین جدایه&#8204;ها مربوط به گونه فلاووس (56%)، اوریزآ (20%) و فومیگاتوس (10%) بودند. 59% بیماران زن و 41% مرد بودند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
			&lt;/td&gt;
		&lt;/tr&gt;
		&lt;tr style=&quot;page-break-inside:avoid;height:35px;&quot;&gt;
			&lt;td style=&quot;width:595px;padding:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt;height:35px;vertical-align:top;&quot;&gt;
			&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;بحث و نتیجه&amp;shy; گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;در مقایسه با تست&#8204;های فنوتیپیک، تعیین توالی ژن بتا توبولین برای شناسایی جدایه&#8204;های بالینی آسپرژیلوس در سطح گونه بسیار با ارزش است. جایگزینی روش&#8204;های مولکولی با روش&#8204;های فنوتیپیک و تشخیص دقیق میکروارگانیسم به&#8204;منظور درمان مؤثر به محققان این عرصه توصیه می&#8204;گردد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
			&lt;/td&gt;
		&lt;/tr&gt;
	&lt;/tbody&gt;
&lt;/table&gt;

&lt;div style=&quot;clear:both;&quot;&gt;&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Background:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;Aspergillus &lt;/em&gt;species are opportunistic pathogens among immunocompromised patients. In terms of pathogenesis and mycotoxin production, they are in great value. The aim of the this study was to evaluate of beta-tubulin gene for identification of clinical &lt;em&gt;Aspergillus &lt;/em&gt;species by PCR-sequencing method compared to morphological features of clinical isolates (such as conidial shape in direct microscopic examination, colony shape in culture, and physiological tests).&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Materials and Methods:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; In this study, 465 patients referred to the Shefa laboratory of Isfahan were evaluated. Morphological and molecular identification of clinical samples were performed using culture on sabouraud agar, malt extract agar, czapekdox agar, direct microscopy, and PCR-sequencing of beta tubulin gene, respectively. Sequences were analyzed in comparison with gene bank data.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Results:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; Thirty nine out of 465 suspected cases (8.4%) had aspergillosis. The most prevalent species were &lt;em&gt;Aspergillus flavus&lt;/em&gt; (56.4%), &lt;em&gt;A. oryzae&lt;/em&gt; (20.5%), and &lt;em&gt;A. fumigatus&lt;/em&gt; (10.2%), respectively. Fifty nine percent of patients were females and 49% were males.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Conclusion:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; In comparison with phenotypic tests, sequencing of beta-tubulin gene for identification of &lt;em&gt;Aspergillus&lt;/em&gt; species is at great value. Replacement of molecular techniques with conventional tests is recommended for precise identification of microorganism for better management of infection.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>آسپرژیلوس, بتا توبولین, تعیین توالی</keyword_fa>
	<keyword>Aspergillus, Beta tubulin, Sequencing</keyword>
	<start_page>87</start_page>
	<end_page>97</end_page>
	<web_url>http://yafte.lums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1693-70&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mahnaz</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kheirkhah</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهناز</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>خیرخواه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>7200319475328460014351</code>
	<orcid>7200319475328460014351</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Parasitology and Mycology,  Faculty  of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه انگل و قارچ شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mostafa</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Chadeganipour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مصطفی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>چادگانی پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>7200319475328460014352</code>
	<orcid>7200319475328460014352</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Parasitology and Mycology, Faculty of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه انگل و قارچ شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Parvin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dehghan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پروین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دهقان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>7200319475328460014353</code>
	<orcid>7200319475328460014353</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Parasitology and Mycology, Faculty  of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه انگل و قارچ شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Rasoul</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mohammadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رسول</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>محمدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Dr.rasoul_mohammadi@yahoo.com</email>
	<code>7200319475328460014354</code>
	<orcid>7200319475328460014354</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Parasitology and Mycology, Faculty  of Medicine, Infectious Diseases and Tropical Medicine Research Center, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه انگل و قارچ شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، مرکز تحقیقات عفونی و گرمسیری، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
