<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>scientific magazine yafte</title>
<title_fa>مجله علمی پژوهشی یافته</title_fa>
<short_title>yafte</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://yafte.lums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>72</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal72</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1563-0773</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2981-0779</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.22034/Yafteh</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>20</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی فراوانی و توالی نوکلئوتیدی ژنهای کد کننده فاکتورهای جذب آهن در ایزوله های پروتئوس میرابیلیس جدا شده از بیماران با عفونت ادراری در ایران</title_fa>
	<title>The frequency and nucleotide sequence of genes encoding the iron adsorption receptors in Proteus mirabilis isolated from patients with urinary tract infections in Iran</title>
	<subject_fa>میکروب شناسی</subject_fa>
	<subject>میکروب شناسی</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي اصیل</content_type_fa>
	<content_type>Original Research </content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;مقدمه&lt;/strong&gt;: فاکتورهای جذب آهن به عنوان یکی از عوامل بیماریزای اصلی سویه های پروتئوس میرابیلیس عامل عفونت ادراری می باشند. هدف از این مطالعه بررسی شیوع ژنهای &lt;em&gt;جذب &lt;/em&gt;آهن و نیز ارزیابی توالی نوکلئوتیدی آنها در ایزوله های پروتئوس میرابیلیس جمع آوری شده از بیماران با عفونت دستگاه ادراری بود.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;مواد و روش ها&lt;/strong&gt;: تعداد 100 ایزوله پروتئوس میرابیلیس از نمونه ادرار بیماران مبتلا به عفونت ادراری جمع آوری شد. &amp;nbsp;تکثیر ژنهای جذب آهن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI1945&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;، &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI2596&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;، &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI0409&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;، &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI1426&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;، &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI0842&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI1425&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در این ایزوله ها با روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; انجام شد. جهت تعیین توالی ژنهای تکثیر یافته، محصول &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; آنها با کیت تخلیص محصول &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&amp;nbsp; از روی ژل تخلیص گردید و سپس برای تعیین توالی ارسال شدند. پس از تعیین توالی، توالی این ژنها با توالی ژنهای موجود در بانک ژن و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Expasy&lt;/span&gt; مقایسه شد.&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;یافته ها: &lt;/strong&gt;بررسی شیوع این ژنها نشان داد که به ترتیب 90%، 25%،&amp;nbsp; 35%، 85%، 75% و 55 درصد از این ایزوله ها دارای ژنهای &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI1945&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;، &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI2596&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;، &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI0409&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;، &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI1426&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;، &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI0842&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI1425&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; بودند. مقایسه توالی نوکلئوتیدی این ژنها با استفاده از برنامه های آنالیز نشان داد که توالی ژنهای جذب آهن شباهت بالای 80 درصد با ژنهای مشابه ثبت شده در بانک های ژنی دارند.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;بحث و نتیجه گیری: &lt;/strong&gt;در این مطالعه مشاهده شد که ژنهای جذب آهن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI1945&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PMI1426&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; با داشتن شیوع زیاد در بین ایزوله های پروتئوس میرابیلیس و نیز توالی حفظ شده می توانند به عنوان کاندید واکسن جدید علیه عفونتهای ادراری مطرح شوند.</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Background: &lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;Iron adsorption factors are among the most important virulence factors of &lt;em&gt;P. mirabilis&lt;/em&gt; causing urinary tract infections. The aim of the present study was the evaluation of the frequency and nucleotide sequence of genes encoding the iron adsorption genes in &lt;em&gt;Proteus mirabilis &lt;/em&gt;isolated from patients with urinary tract infections.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Materials and Methods: &lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;In total, 100 &lt;em&gt;P. mirabilis&lt;/em&gt; isolates were obtained from urine samples of patients with urinary tract infections. Amplification of the iron adsorption genes in the isolates was performed by PCR. For sequencing of the amplified genes, their PCR products were purified from agarose gel using a PCR purification kit and sent for sequencing. After sequencing, the sequences of these genes were compared with the genes deposited in GenBank and Expasy.&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Results:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; The frequency of &lt;em&gt;PMI1945, PMI2596, PMI0409, PMI1426, PMI0842 &lt;/em&gt;and&lt;em&gt; PMI1425 &lt;/em&gt;genes in the isolates was 90%, 25%, 35%, 85%, 75% and 55%. Comparison of the nucleotide sequences of these genes using analysis software showed similarity higher than 80% between the sequences of the iron adsorption genes with the iron sequences deposited in Genbank and Expasy.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Conclusion:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; In this study, it was observed that the iron adsorption genes &lt;em&gt;PMI1945&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;PMI1426&lt;/em&gt; with high frequency and conserved sequences among &lt;em&gt;P. mirabilis&lt;/em&gt; could be presented as novel vaccine candidates against urinary tract infections.&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>پروتئوس میرابیلیس, فاکتورهای جذب آهن, تعیین توالی</keyword_fa>
	<keyword>Proteus mirabilis, Iron adsorption receptors, Sequencing</keyword>
	<start_page>28</start_page>
	<end_page>38</end_page>
	<web_url>http://yafte.lums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2209-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mehri</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Habibi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهری</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حبیبی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m_habibi@yahoo.com</email>
	<code>7200319475328460018204</code>
	<orcid>7200319475328460018204</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Molecular Biology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش بیولوژی ملکولی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Asadi Karam</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اسدی کرم</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m_asadi12@yahoo.com</email>
	<code>7200319475328460018205</code>
	<orcid>7200319475328460018205</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Molecular Biology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش بیولوژی ملکولی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
