scientific magazine yafte

fa بررسی عملکرد مولکولی بیان ژنی در ارتباط با عفونت‌های ویروسی سین سیشیال تنفسی Investigating the Molecular Function of Gene Expression in Relation to Respiratory Syncytial Virus Infections ویروس شناسی پژوهشي اصیل Original Research <table align="right" class="Table" dir="rtl" style="width:596px; border-collapse:collapse; margin-left:9px; margin-right:9px" width="596"> <tbody> <tr> <td style="width: 596px; padding: 0in 7px; height: 1px; text-align: justify;" valign="top">مقدمه: مطالعات نشان داده است که تا 68 درصد از نوزادان ممکن است در سال اول زندگی خود به ویروس سین سیشیال تنفسی (RSV) مبتلا شوند و تقریباً همه کودکان تا دوسالگی مبتلا می‌شوند. در این مطالعه با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک به بررسی و کاندید نمودن ژن‌های موجود در مسیرهای وابسته به عفونت ویروس سین سیشیال تنفسی (RSV) پرداخته شد. مواد و روش ها: با مراجعه به پایگاه داده GEO مجموعه داده‌ها (دیتاست) مناسب برای آنالیز انتخاب گردید. این دیتاست شامل پروفایل بیان ژنی در عفونت ویروس سین سیشیال تنفسی (RSV) بود. کلاسترهای ژنی با بیان بالا و پایین دسته‌بندی شدند. برای ارزیابی دقیق‌تر داده از پایگاه‌های داده غنی همچون Enrichr، STRING و Panther استفاده شد. در نهایت ژن‌های کاندید شده جدا و ارتباط پروتئینی آن‌ها نیز سنجیده شد. یافته ها: 740 ژن، افزایش بیان و 822 ژن، کاهش بیان داشتند. که این ژن‌ها می‌توانند در مسیرهای عفونت ویروس سین سیشیال تنفسی در کودکان نقش داشته باشند. مسیرهای NOD like receptor، اپشتین بار- آنفلوآنزا، توبرکلوزیس، لیشمانیازیس، نکروپتوزیس و سالمونلا بیان بالا داشته و مسیرهای کرونا ویروس، هرپس ویروس، نقص سیستم ایمنی، گیرنده سلول‌های لنفوسیت 1Th، ریبوزوم، NFKappa B و 1PDL در نقاط وارسی چرخه سلولی  بیان پایین داشتند. بحث و نتیجه گیری: مطالعه حاضر نشان داد، که پروتئین‌ها و ژن‌های مهم در تقویت التهاب ویروس سین سیشیال تنفسی در کودکان نقش عمده‌ای دارد. که از میان آن‌ها " 3 STAT، 4 TLR A26,RPL1STAT و 4 MAPK" نقش بارزتری را در این مسیر نشان دادند.</td> </tr> </tbody> </table> <div style="text-align: justify;">Background: Studies have shown that up to 68% of infants may be infected with respiratory syncytial virus (RSV) in their first year of life, and almost all children are infected by the age of two. In this study, using bioinformatics analysis, the genes in the pathways related to respiratory syncytial virus (RSV) infection were examined and nominated. Materials and Methods: By referring to the GEO database, the appropriate dataset was selected for analysis. This dataset included gene expression profiles in respiratory syncytial virus (RSV) infection. Gene clusters with high and low expression were categorized. Rich databases such as Enrichr, STRING, and Panther were used for more accurate data evaluation. Finally, the candidate genes were isolated, and their protein relationship was also measured. Results: A total of 740 and 822 genes had high and low expressions, respectively. These genes can play a role in RSV infection pathways in children. The NOD-like receptor, Epstein-Barr-influenza, tuberculosis, leishmaniasis, necroptosis, and salmonella pathways are highly expressed, and the pathways of coronavirus, herpes virus, immune system deficiency, Th1 lymphocyte cell receptor, ribosome, NFKappa B, and PDL1 had low expression at checkpoints of the cell cycle. Conclusion: The present study revealed that important proteins and genes played a major role in strengthening RSV inflammation in children, among which STAT3, TLR4, RPL26A, STAT1, and MAPK4 showed a more prominent role in this pathway.  </div> ویروس سین سیشیال تنفسی, پروفایل بیان ژن, آنالیز بیوانفورماتیک, سلول‌های نازوفارنژ Bioinformatic analysis, Gene expression profile, Nasopharyngeal cells, Respiratory syncytial virus (RSV) 51 65 http://yafte.lums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2712-5&slc_lang=fa&sid=1 Masoumeh Hamidiian معصومه حمیدیان masoome.hamidian@gmail.com 7200319475328460027659 0009-0004-4561-4687 No Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Islamshahr Branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد اسلامشهر دانشگاه آزاد اسلامی، اسلامشهر، تهران، ایران Mahnaz Mohammadi مهناز محمدی mh_mohamadi@yahoo.com 7200319475328460027660 7200319475328460027660 No Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Islamshahr Branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد اسلامشهر دانشگاه آزاد اسلامی، اسلامشهر، تهران، ایران Behnaz Esfandiari بهناز اسفندیاری me_esfandiari2000@yahoo.com 7200319475328460027661 7200319475328460027661 Yes Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Islamshahr Branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد اسلامشهر دانشگاه آزاد اسلامی، اسلامشهر، تهران، ایران